Народився в 1939 році. У 1962 році закінчив механіко-математичний факультет Львівського державного економічного університету ім. І.Франка за спеціальністю математика. Дисертацію захистив у 1968 році в спеціалізованій Вченій раді Київського інституту народного господарства ім. Д. С. Коротченка за спеціальністю “Математичні методи і використання обчислювальної техніки в економічних дослідженнях, плануванні та управлінні народним господарством і його галузями”. Стаж педагогічної роботи Наконечного С. І. у вищому навчальному закладі — 44 роки. З жовтня 1989 року по вересень 2005 року працював на посаді завідуючого кафедри економіко-математичних методів КНЕУ.
    Працюючи завідуючим кафедрою ЕММ, Наконечний С. І. виступив організатором і активним розробником повного методичного забезпечення навчальних курсів (чотири дисципліни) економіко-математичного циклу на бакалаврському рівні, сімох економіко-математичних дисциплін на магістерських програмах. Під керівництвом Наконечного С. І. та за його безпосередньою участю вперше в Україні розроблено магістерську програму “Системний аналіз та моделювання економічних процесів”. Наконечний С. І. є автором нових лекційних курсів магістерського циклу “Методи і моделі прийняття рішень в аналізі та аудиті” та “Моделювання інноваційно-інвестиційних процесів” і їх методичного забезпечення, був ініціатором уведеня в навчальний план дисципліни “Економічний ризик і методи його вимірювання”, яку на сьогодні під назвою “Ризикологія” викладають в усіх економічних вузах; підготував з цієї дисципліни навчально-методичне забезпечення (два підручники з грифом МОН, програму і дві методичні розробки).